Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apex1P28352 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apex1P28352 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apex1P28352 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apex1P28352 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apex1P28352 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Apex1P28352 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apex1P28352 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apex1P28352 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apex1P28352 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apex1P28352 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apex1P28352 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apex1P28352 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apex1P28352 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms