Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LoxP28301 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LoxP28301 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LoxP28301 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LoxP28301 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LoxP28301 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LoxP28301 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LoxP28301 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LoxP28301 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LoxP28301 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LoxP28301 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LoxP28301 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LoxP28301 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LoxP28301 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LoxP28301 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LoxP28301 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LoxP28301 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LoxP28301 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LoxP28301 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LoxP28301 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LoxP28301 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LoxP28301 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LoxP28301 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LoxP28301 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LoxP28301 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LoxP28301 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LoxP28301 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LoxP28301 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LoxP28301 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LoxP28301 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LoxP28301 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LoxP28301 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LoxP28301 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LoxP28301 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LoxP28301 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LoxP28301 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LoxP28301 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LoxP28301 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LoxP28301 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LoxP28301 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LoxP28301 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LoxP28301 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LoxP28301 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LoxP28301 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LoxP28301 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LoxP28301 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LoxP28301 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LoxP28301 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LoxP28301 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LoxP28301 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LoxP28301 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LoxP28301 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LoxP28301 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LoxP28301 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LoxP28301 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LoxP28301 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LoxP28301 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LoxP28301 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LoxP28301 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LoxP28301 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LoxP28301 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LoxP28301 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LoxP28301 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LoxP28301 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LoxP28301 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LoxP28301 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LoxP28301 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LoxP28301 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LoxP28301 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LoxP28301 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LoxP28301 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LoxP28301 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LoxP28301 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LoxP28301 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LoxP28301 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LoxP28301 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LoxP28301 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LoxP28301 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LoxP28301 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LoxP28301 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LoxP28301 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LoxP28301 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LoxP28301 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LoxP28301 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LoxP28301 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LoxP28301 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LoxP28301 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LoxP28301 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LoxP28301 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LoxP28301 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LoxP28301 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LoxP28301 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LoxP28301 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LoxP28301 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LoxP28301 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LoxP28301 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LoxP28301 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LoxP28301 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LoxP28301 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LoxP28301 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms