Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ChgaP26339 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ChgaP26339 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ChgaP26339 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ChgaP26339 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ChgaP26339 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChgaP26339 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChgaP26339 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ChgaP26339 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ChgaP26339 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChgaP26339 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChgaP26339 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ChgaP26339 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ChgaP26339 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ChgaP26339 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ChgaP26339 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ChgaP26339 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ChgaP26339 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ChgaP26339 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ChgaP26339 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChgaP26339 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChgaP26339 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChgaP26339 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChgaP26339 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChgaP26339 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChgaP26339 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChgaP26339 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChgaP26339 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChgaP26339 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChgaP26339 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChgaP26339 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChgaP26339 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChgaP26339 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChgaP26339 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChgaP26339 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChgaP26339 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChgaP26339 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChgaP26339 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChgaP26339 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChgaP26339 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChgaP26339 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChgaP26339 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms