Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gria1P23818 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gria1P23818 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gria1P23818 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gria1P23818 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gria1P23818 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gria1P23818 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gria1P23818 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms