Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxd11P23813 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxd11P23813 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Gm17983-201ENSMUST00000190766 594 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd11P23813 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms