Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd12P23812 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd12P23812 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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