Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BdnfP21237 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BdnfP21237 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BdnfP21237 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BdnfP21237 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BdnfP21237 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BdnfP21237 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BdnfP21237 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BdnfP21237 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BdnfP21237 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BdnfP21237 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BdnfP21237 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms