Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fcer1aP20489 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fcer1aP20489 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms