Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP20293 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP20293 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP20293 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP20293 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP20293 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP20293 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TP20293 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TP20293 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TP20293 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TP20293 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TP20293 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TP20293 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TP20293 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TP20293 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TP20293 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TP20293 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TP20293 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TP20293 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TP20293 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TP20293 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TP20293 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TP20293 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TP20293 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TP20293 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TP20293 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TP20293 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TP20293 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TP20293 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TP20293 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TP20293 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TP20293 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TP20293 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TP20293 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TP20293 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP20293 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP20293 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP20293 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP20293 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP20293 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TP20293 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TP20293 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP20293 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP20293 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP20293 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP20293 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP20293 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP20293 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TP20293 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TP20293 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TP20293 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TP20293 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TP20293 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TP20293 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TP20293 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TP20293 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TP20293 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TP20293 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TP20293 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TP20293 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TP20293 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TP20293 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TP20293 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TP20293 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TP20293 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TP20293 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TP20293 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TP20293 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TP20293 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TP20293 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TP20293 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TP20293 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TP20293 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TP20293 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TP20293 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TP20293 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TP20293 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TP20293 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TP20293 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TP20293 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TP20293 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TP20293 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TP20293 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TP20293 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TP20293 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TP20293 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TP20293 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TP20293 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TP20293 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TP20293 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TP20293 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TP20293 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TP20293 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TP20293 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TP20293 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TP20293 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TP20293 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TP20293 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TP20293 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TP20293 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms