Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PdgfaP20033 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PdgfaP20033 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PdgfaP20033 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PdgfaP20033 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PdgfaP20033 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PdgfaP20033 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PdgfaP20033 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PdgfaP20033 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PdgfaP20033 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PdgfaP20033 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PdgfaP20033 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PdgfaP20033 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms