Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms