Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sptan1P16546 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptan1P16546 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms