Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim30aP15533 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trim30aP15533 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim30aP15533 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim30aP15533 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trim30aP15533 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim30aP15533 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim30aP15533 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim30aP15533 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim30aP15533 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim30aP15533 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim30aP15533 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trim30aP15533 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim30aP15533 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim30aP15533 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim30aP15533 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim30aP15533 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim30aP15533 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim30aP15533 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim30aP15533 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim30aP15533 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim30aP15533 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trim30aP15533 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim30aP15533 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim30aP15533 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim30aP15533 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim30aP15533 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim30aP15533 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim30aP15533 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim30aP15533 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim30aP15533 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim30aP15533 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim30aP15533 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trim30aP15533 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim30aP15533 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim30aP15533 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim30aP15533 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim30aP15533 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim30aP15533 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim30aP15533 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim30aP15533 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim30aP15533 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim30aP15533 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim30aP15533 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim30aP15533 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim30aP15533 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim30aP15533 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim30aP15533 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim30aP15533 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim30aP15533 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30aP15533 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30aP15533 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30aP15533 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30aP15533 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30aP15533 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30aP15533 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30aP15533 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30aP15533 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30aP15533 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30aP15533 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30aP15533 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30aP15533 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30aP15533 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30aP15533 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30aP15533 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30aP15533 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30aP15533 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim30aP15533 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trim30aP15533 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim30aP15533 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim30aP15533 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim30aP15533 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim30aP15533 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim30aP15533 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim30aP15533 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trim30aP15533 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim30aP15533 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim30aP15533 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim30aP15533 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim30aP15533 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim30aP15533 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trim30aP15533 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trim30aP15533 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trim30aP15533 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trim30aP15533 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trim30aP15533 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim30aP15533 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim30aP15533 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim30aP15533 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim30aP15533 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim30aP15533 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim30aP15533 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim30aP15533 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim30aP15533 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim30aP15533 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim30aP15533 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms