Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SptbP15508 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SptbP15508 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SptbP15508 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SptbP15508 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SptbP15508 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SptbP15508 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SptbP15508 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SptbP15508 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SptbP15508 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SptbP15508 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SptbP15508 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SptbP15508 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SptbP15508 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SptbP15508 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SptbP15508 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SptbP15508 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SptbP15508 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SptbP15508 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SptbP15508 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SptbP15508 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SptbP15508 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SptbP15508 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SptbP15508 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SptbP15508 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SptbP15508 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SptbP15508 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SptbP15508 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SptbP15508 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SptbP15508 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SptbP15508 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SptbP15508 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SptbP15508 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SptbP15508 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SptbP15508 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SptbP15508 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SptbP15508 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SptbP15508 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SptbP15508 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SptbP15508 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SptbP15508 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SptbP15508 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SptbP15508 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SptbP15508 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SptbP15508 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SptbP15508 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SptbP15508 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SptbP15508 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SptbP15508 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SptbP15508 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SptbP15508 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SptbP15508 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SptbP15508 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SptbP15508 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SptbP15508 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SptbP15508 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SptbP15508 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SptbP15508 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SptbP15508 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SptbP15508 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SptbP15508 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SptbP15508 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SptbP15508 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SptbP15508 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SptbP15508 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SptbP15508 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SptbP15508 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SptbP15508 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SptbP15508 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SptbP15508 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SptbP15508 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SptbP15508 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SptbP15508 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SptbP15508 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SptbP15508 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SptbP15508 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SptbP15508 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SptbP15508 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SptbP15508 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SptbP15508 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SptbP15508 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SptbP15508 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SptbP15508 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SptbP15508 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SptbP15508 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SptbP15508 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SptbP15508 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SptbP15508 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SptbP15508 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SptbP15508 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SptbP15508 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SptbP15508 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SptbP15508 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SptbP15508 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SptbP15508 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SptbP15508 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SptbP15508 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SptbP15508 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SptbP15508 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SptbP15508 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms