Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms