Protein–RNA interactions for Protein: P11087

Col1a1, Collagen alpha-1(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a1P11087 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col1a1P11087 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms