Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cd8bP10300 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms