Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Schip1P0DPB4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Schip1P0DPB4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Schip1P0DPB4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms