Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CatspereP0DP43 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms