Protein–RNA interactions for Protein: P0C871

Pla2g4b, Cytosolic phospholipase A2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pla2g4bP0C871 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pla2g4bP0C871 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pla2g4bP0C871 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms