Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Surf1P09925 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Surf1P09925 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Surf1P09925 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Surf1P09925 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Surf1P09925 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Surf1P09925 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Surf1P09925 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Surf1P09925 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms