Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxc9P09633 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxc9P09633 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxc9P09633 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxc9P09633 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxc9P09633 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxc9P09633 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxc9P09633 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxc9P09633 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxc9P09633 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxc9P09633 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxc9P09633 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxc9P09633 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxc9P09633 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxc9P09633 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hoxc9P09633 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hoxc9P09633 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hoxc9P09633 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxc9P09633 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms