Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtaP09225 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtaP09225 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtaP09225 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtaP09225 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtaP09225 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtaP09225 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtaP09225 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtaP09225 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtaP09225 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtaP09225 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtaP09225 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtaP09225 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtaP09225 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtaP09225 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtaP09225 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtaP09225 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtaP09225 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtaP09225 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtaP09225 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtaP09225 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtaP09225 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LtaP09225 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtaP09225 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtaP09225 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtaP09225 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtaP09225 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtaP09225 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtaP09225 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtaP09225 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtaP09225 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtaP09225 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LtaP09225 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtaP09225 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtaP09225 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtaP09225 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtaP09225 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtaP09225 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtaP09225 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtaP09225 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtaP09225 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtaP09225 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtaP09225 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LtaP09225 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtaP09225 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtaP09225 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LtaP09225 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtaP09225 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LtaP09225 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LtaP09225 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LtaP09225 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtaP09225 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtaP09225 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtaP09225 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtaP09225 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtaP09225 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtaP09225 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtaP09225 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtaP09225 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtaP09225 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtaP09225 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtaP09225 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtaP09225 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtaP09225 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtaP09225 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtaP09225 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtaP09225 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtaP09225 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtaP09225 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtaP09225 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtaP09225 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtaP09225 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtaP09225 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LtaP09225 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtaP09225 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtaP09225 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtaP09225 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LtaP09225 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LtaP09225 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LtaP09225 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LtaP09225 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LtaP09225 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LtaP09225 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LtaP09225 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LtaP09225 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LtaP09225 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LtaP09225 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LtaP09225 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LtaP09225 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LtaP09225 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LtaP09225 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LtaP09225 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LtaP09225 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LtaP09225 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LtaP09225 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LtaP09225 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LtaP09225 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LtaP09225 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtaP09225 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtaP09225 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms