Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax1P09084 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax1P09084 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax1P09084 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax1P09084 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax1P09084 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax1P09084 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax1P09084 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax1P09084 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax1P09084 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax1P09084 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax1P09084 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax1P09084 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax1P09084 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax1P09084 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax1P09084 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax1P09084 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax1P09084 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax1P09084 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax1P09084 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax1P09084 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax1P09084 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax1P09084 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax1P09084 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax1P09084 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax1P09084 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax1P09084 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax1P09084 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax1P09084 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax1P09084 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax1P09084 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax1P09084 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax1P09084 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Pax1P09084 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax1P09084 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax1P09084 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax1P09084 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax1P09084 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax1P09084 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax1P09084 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms