Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa5P09021 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms