Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna4P07351 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms