Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Me1P06801 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Me1P06801 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Me1P06801 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Me1P06801 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Me1P06801 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Me1P06801 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Me1P06801 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Me1P06801 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Me1P06801 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Me1P06801 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Me1P06801 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Me1P06801 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Me1P06801 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Me1P06801 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Me1P06801 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Me1P06801 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Me1P06801 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Me1P06801 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Me1P06801 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Me1P06801 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Me1P06801 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Me1P06801 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Me1P06801 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Me1P06801 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Me1P06801 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Me1P06801 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Me1P06801 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Me1P06801 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Me1P06801 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Me1P06801 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Me1P06801 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Me1P06801 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Me1P06801 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Me1P06801 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Me1P06801 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Me1P06801 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Me1P06801 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Me1P06801 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Me1P06801 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Me1P06801 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Me1P06801 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Me1P06801 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Me1P06801 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Me1P06801 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Me1P06801 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Me1P06801 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Me1P06801 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Me1P06801 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Me1P06801 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Me1P06801 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Me1P06801 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Me1P06801 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Me1P06801 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Me1P06801 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Me1P06801 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Me1P06801 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Me1P06801 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Me1P06801 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Me1P06801 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Me1P06801 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Me1P06801 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Me1P06801 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Me1P06801 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Me1P06801 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Me1P06801 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Me1P06801 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Me1P06801 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Me1P06801 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Me1P06801 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Me1P06801 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Me1P06801 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Me1P06801 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Me1P06801 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Me1P06801 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Me1P06801 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Me1P06801 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Me1P06801 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Me1P06801 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Me1P06801 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Me1P06801 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Me1P06801 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Me1P06801 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Me1P06801 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Me1P06801 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Me1P06801 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Me1P06801 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Me1P06801 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Me1P06801 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Me1P06801 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Me1P06801 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Me1P06801 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Me1P06801 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Me1P06801 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Me1P06801 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Me1P06801 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Me1P06801 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Me1P06801 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Me1P06801 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Me1P06801 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms