Protein–RNA interactions for Protein: P04235

Cd3d, T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3dP04235 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cd3dP04235 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd3dP04235 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cd3dP04235 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cd3dP04235 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cd3dP04235 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd3dP04235 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd3dP04235 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd3dP04235 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd3dP04235 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd3dP04235 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd3dP04235 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd3dP04235 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd3dP04235 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd3dP04235 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd3dP04235 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd3dP04235 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd3dP04235 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd3dP04235 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd3dP04235 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd3dP04235 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd3dP04235 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd3dP04235 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd3dP04235 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd3dP04235 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd3dP04235 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd3dP04235 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd3dP04235 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd3dP04235 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd3dP04235 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd3dP04235 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd3dP04235 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd3dP04235 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd3dP04235 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms