Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
H2-Eb1P04230 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms