Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
P04212 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P04212 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P04212 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P04212 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P04212 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P04212 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P04212 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P04212 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P04212 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P04212 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04212 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04212 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04212 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04212 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04212 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04212 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04212 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04212 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04212 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04212 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04212 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04212 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04212 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04212 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04212 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04212 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04212 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04212 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04212 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04212 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04212 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04212 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04212 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04212 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04212 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04212 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P04212 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04212 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04212 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04212 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04212 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04212 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04212 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04212 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04212 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04212 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04212 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04212 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04212 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P04212 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04212 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04212 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04212 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04212 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04212 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04212 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04212 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04212 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04212 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04212 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04212 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04212 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04212 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04212 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04212 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04212 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04212 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04212 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04212 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04212 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04212 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04212 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04212 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04212 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04212 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04212 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04212 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04212 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04212 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04212 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04212 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04212 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04212 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04212 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04212 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04212 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04212 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P04212 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04212 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04212 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04212 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04212 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04212 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04212 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04212 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P04212 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04212 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P04212 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P04212 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms