Protein–RNA interactions for Protein: P01887

B2m, Beta-2-microglobulin, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B2mP01887 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B2mP01887 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B2mP01887 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B2mP01887 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B2mP01887 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B2mP01887 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B2mP01887 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B2mP01887 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B2mP01887 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
B2mP01887 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B2mP01887 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B2mP01887 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B2mP01887 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B2mP01887 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B2mP01887 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B2mP01887 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B2mP01887 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B2mP01887 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B2mP01887 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B2mP01887 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B2mP01887 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B2mP01887 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B2mP01887 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B2mP01887 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B2mP01887 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B2mP01887 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B2mP01887 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B2mP01887 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B2mP01887 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B2mP01887 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B2mP01887 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B2mP01887 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B2mP01887 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B2mP01887 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B2mP01887 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B2mP01887 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
B2mP01887 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
B2mP01887 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
B2mP01887 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
B2mP01887 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B2mP01887 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B2mP01887 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B2mP01887 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B2mP01887 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B2mP01887 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B2mP01887 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
B2mP01887 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B2mP01887 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
B2mP01887 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B2mP01887 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B2mP01887 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B2mP01887 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B2mP01887 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B2mP01887 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B2mP01887 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B2mP01887 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B2mP01887 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B2mP01887 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B2mP01887 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B2mP01887 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B2mP01887 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B2mP01887 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B2mP01887 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B2mP01887 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B2mP01887 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B2mP01887 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B2mP01887 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B2mP01887 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B2mP01887 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B2mP01887 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B2mP01887 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B2mP01887 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
B2mP01887 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B2mP01887 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B2mP01887 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B2mP01887 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B2mP01887 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B2mP01887 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B2mP01887 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B2mP01887 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B2mP01887 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
B2mP01887 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B2mP01887 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B2mP01887 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B2mP01887 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B2mP01887 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B2mP01887 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B2mP01887 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B2mP01887 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B2mP01887 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B2mP01887 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
B2mP01887 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B2mP01887 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B2mP01887 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B2mP01887 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B2mP01887 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B2mP01887 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B2mP01887 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B2mP01887 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B2mP01887 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.5 ms