Protein–RNA interactions for Protein: P01783

Ig heavy chain V region MOPC 21 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01783 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01783 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01783 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01783 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01783 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01783 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01783 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01783 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01783 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01783 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01783 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01783 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01783 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01783 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01783 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01783 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01783 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01783 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01783 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01783 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01783 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01783 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01783 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01783 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01783 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01783 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01783 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01783 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01783 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01783 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01783 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01783 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01783 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01783 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01783 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01783 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01783 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01783 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01783 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01783 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01783 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01783 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01783 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01783 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01783 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01783 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01783 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01783 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01783 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01783 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01783 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01783 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01783 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01783 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01783 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01783 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01783 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01783 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01783 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01783 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01783 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01783 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01783 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01783 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01783 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01783 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01783 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01783 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01783 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01783 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01783 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01783 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01783 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01783 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01783 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01783 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01783 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01783 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01783 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01783 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01783 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01783 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01783 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01783 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01783 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01783 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01783 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01783 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01783 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01783 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01783 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01783 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01783 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01783 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01783 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01783 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01783 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01783 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01783 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01783 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms