Protein–RNA interactions for Protein: P01746

Ig heavy chain V region 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01746 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01746 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01746 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01746 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01746 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01746 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01746 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01746 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01746 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01746 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01746 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
P01746 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01746 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01746 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01746 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01746 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01746 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01746 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01746 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01746 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01746 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01746 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01746 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01746 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01746 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01746 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
P01746 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01746 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01746 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
P01746 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01746 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01746 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01746 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01746 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01746 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01746 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01746 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01746 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01746 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01746 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01746 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01746 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
P01746 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01746 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01746 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01746 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01746 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01746 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
P01746 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01746 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01746 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01746 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01746 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01746 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01746 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01746 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01746 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01746 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01746 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
P01746 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01746 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01746 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01746 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01746 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01746 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01746 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01746 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01746 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01746 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01746 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
P01746 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
P01746 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
P01746 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
P01746 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
P01746 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
P01746 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
P01746 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
P01746 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
P01746 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
P01746 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01746 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01746 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01746 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01746 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01746 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01746 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01746 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01746 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01746 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01746 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01746 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
P01746 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01746 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01746 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01746 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01746 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01746 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01746 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01746 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01746 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms