Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ifnb1P01575 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms