Protein–RNA interactions for Protein: O89001

Cpd, Carboxypeptidase D, mousemouse

Predictions only

Length 1,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpdO89001 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CpdO89001 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CpdO89001 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CpdO89001 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CpdO89001 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CpdO89001 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CpdO89001 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CpdO89001 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CpdO89001 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CpdO89001 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CpdO89001 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CpdO89001 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CpdO89001 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CpdO89001 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CpdO89001 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CpdO89001 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CpdO89001 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CpdO89001 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CpdO89001 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CpdO89001 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CpdO89001 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CpdO89001 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CpdO89001 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CpdO89001 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CpdO89001 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CpdO89001 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CpdO89001 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CpdO89001 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CpdO89001 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CpdO89001 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CpdO89001 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CpdO89001 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CpdO89001 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CpdO89001 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CpdO89001 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CpdO89001 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CpdO89001 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CpdO89001 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CpdO89001 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CpdO89001 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CpdO89001 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CpdO89001 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CpdO89001 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CpdO89001 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CpdO89001 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CpdO89001 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CpdO89001 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CpdO89001 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CpdO89001 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CpdO89001 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CpdO89001 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CpdO89001 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CpdO89001 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CpdO89001 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CpdO89001 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CpdO89001 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CpdO89001 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CpdO89001 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CpdO89001 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CpdO89001 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CpdO89001 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CpdO89001 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CpdO89001 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CpdO89001 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CpdO89001 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CpdO89001 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CpdO89001 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CpdO89001 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CpdO89001 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CpdO89001 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CpdO89001 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CpdO89001 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CpdO89001 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CpdO89001 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CpdO89001 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CpdO89001 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CpdO89001 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CpdO89001 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CpdO89001 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CpdO89001 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CpdO89001 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CpdO89001 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CpdO89001 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CpdO89001 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CpdO89001 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CpdO89001 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CpdO89001 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CpdO89001 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CpdO89001 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CpdO89001 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CpdO89001 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CpdO89001 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CpdO89001 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CpdO89001 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CpdO89001 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CpdO89001 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CpdO89001 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CpdO89001 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CpdO89001 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CpdO89001 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms