Protein–RNA interactions for Protein: O88728

Ifitm5, Interferon-induced transmembrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm5O88728 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifitm5O88728 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifitm5O88728 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110 ms