Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CntfrO88507 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CntfrO88507 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CntfrO88507 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CntfrO88507 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CntfrO88507 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CntfrO88507 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CntfrO88507 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CntfrO88507 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CntfrO88507 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CntfrO88507 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CntfrO88507 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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