Protein–RNA interactions for Protein: O70439

Stx7, Syntaxin-7, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx7O70439 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx7O70439 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx7O70439 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stx7O70439 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stx7O70439 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms