Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxq1O70220 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxq1O70220 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxq1O70220 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxq1O70220 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxq1O70220 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxq1O70220 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxq1O70220 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Foxq1O70220 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Foxq1O70220 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Foxq1O70220 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxq1O70220 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxq1O70220 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxq1O70220 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxq1O70220 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxq1O70220 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxq1O70220 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxq1O70220 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxq1O70220 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxq1O70220 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxq1O70220 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxq1O70220 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms