Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmb5O55234 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmb5O55234 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmb5O55234 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmb5O55234 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmb5O55234 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb5O55234 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb5O55234 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb5O55234 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb5O55234 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb5O55234 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb5O55234 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb5O55234 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb5O55234 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psmb5O55234 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psmb5O55234 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psmb5O55234 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb5O55234 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb5O55234 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms