Protein–RNA interactions for Protein: O55208

Figla, Factor in the germline alpha, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FiglaO55208 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FiglaO55208 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FiglaO55208 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FiglaO55208 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FiglaO55208 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FiglaO55208 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FiglaO55208 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FiglaO55208 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FiglaO55208 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms