Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atp2a2O55143 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp2a2O55143 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms