Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms