Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Copb2O55029 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Copb2O55029 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Copb2O55029 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Copb2O55029 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Copb2O55029 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Copb2O55029 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Copb2O55029 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Copb2O55029 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Copb2O55029 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms