Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bnip3O55003 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms