Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NlkO54949 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NlkO54949 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NlkO54949 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NlkO54949 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NlkO54949 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NlkO54949 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NlkO54949 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NlkO54949 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NlkO54949 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NlkO54949 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NlkO54949 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NlkO54949 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NlkO54949 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NlkO54949 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NlkO54949 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NlkO54949 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NlkO54949 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NlkO54949 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NlkO54949 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NlkO54949 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NlkO54949 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NlkO54949 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NlkO54949 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NlkO54949 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NlkO54949 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NlkO54949 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NlkO54949 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NlkO54949 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NlkO54949 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NlkO54949 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NlkO54949 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NlkO54949 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NlkO54949 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NlkO54949 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NlkO54949 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NlkO54949 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NlkO54949 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NlkO54949 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NlkO54949 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NlkO54949 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NlkO54949 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NlkO54949 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NlkO54949 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NlkO54949 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NlkO54949 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NlkO54949 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NlkO54949 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NlkO54949 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NlkO54949 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NlkO54949 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NlkO54949 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NlkO54949 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NlkO54949 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NlkO54949 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NlkO54949 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NlkO54949 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NlkO54949 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NlkO54949 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NlkO54949 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NlkO54949 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NlkO54949 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NlkO54949 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NlkO54949 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NlkO54949 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NlkO54949 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NlkO54949 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NlkO54949 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NlkO54949 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NlkO54949 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NlkO54949 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NlkO54949 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NlkO54949 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NlkO54949 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NlkO54949 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NlkO54949 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NlkO54949 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NlkO54949 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NlkO54949 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NlkO54949 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NlkO54949 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NlkO54949 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NlkO54949 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NlkO54949 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NlkO54949 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NlkO54949 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NlkO54949 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NlkO54949 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NlkO54949 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NlkO54949 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NlkO54949 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NlkO54949 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NlkO54949 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NlkO54949 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NlkO54949 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NlkO54949 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NlkO54949 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NlkO54949 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NlkO54949 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NlkO54949 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms