Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh16O54909 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rdh16O54909 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rdh16O54909 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh16O54909 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh16O54909 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh16O54909 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh16O54909 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh16O54909 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh16O54909 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh16O54909 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh16O54909 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh16O54909 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh16O54909 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh16O54909 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh16O54909 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh16O54909 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh16O54909 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh16O54909 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh16O54909 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh16O54909 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh16O54909 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh16O54909 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh16O54909 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh16O54909 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh16O54909 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh16O54909 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh16O54909 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh16O54909 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms