Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itgb3O54890 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itgb3O54890 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itgb3O54890 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itgb3O54890 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Itgb3O54890 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itgb3O54890 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itgb3O54890 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itgb3O54890 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itgb3O54890 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Itgb3O54890 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itgb3O54890 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itgb3O54890 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb3O54890 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb3O54890 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb3O54890 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb3O54890 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb3O54890 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb3O54890 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb3O54890 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb3O54890 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb3O54890 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb3O54890 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb3O54890 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms