Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffbO54788 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffbO54788 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffbO54788 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffbO54788 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DffbO54788 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffbO54788 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffbO54788 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffbO54788 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffbO54788 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffbO54788 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffbO54788 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffbO54788 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffbO54788 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DffbO54788 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DffbO54788 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DffbO54788 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DffbO54788 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DffbO54788 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DffbO54788 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DffbO54788 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DffbO54788 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DffbO54788 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DffbO54788 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DffbO54788 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DffbO54788 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DffbO54788 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DffbO54788 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DffbO54788 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DffbO54788 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DffbO54788 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DffbO54788 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DffbO54788 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DffbO54788 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DffbO54788 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DffbO54788 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DffbO54788 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DffbO54788 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DffbO54788 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DffbO54788 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DffbO54788 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DffbO54788 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DffbO54788 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DffbO54788 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DffbO54788 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DffbO54788 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffbO54788 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffbO54788 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffbO54788 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffbO54788 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffbO54788 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffbO54788 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffbO54788 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffbO54788 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DffbO54788 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffbO54788 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffbO54788 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffbO54788 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DffbO54788 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DffbO54788 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DffbO54788 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DffbO54788 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DffbO54788 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DffbO54788 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DffbO54788 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DffbO54788 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DffbO54788 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DffbO54788 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DffbO54788 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DffbO54788 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
DffbO54788 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DffbO54788 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DffbO54788 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DffbO54788 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DffbO54788 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DffbO54788 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DffbO54788 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DffbO54788 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DffbO54788 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DffbO54788 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DffbO54788 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DffbO54788 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DffbO54788 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DffbO54788 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DffbO54788 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DffbO54788 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DffbO54788 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DffbO54788 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DffbO54788 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DffbO54788 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DffbO54788 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DffbO54788 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DffbO54788 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DffbO54788 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DffbO54788 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DffbO54788 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DffbO54788 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DffbO54788 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DffbO54788 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DffbO54788 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms