Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Srpk2O54781 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Srpk2O54781 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms